La plupart des molécules sont visualisables en 3D avec le logiciel gratuit
Rasmol.
L'exécutable Windows est à télécharger ici.
Une base restreinte des molécules (format de fichiers PDB) étudiées en classe se trouve ici.
Vous trouverez évidemment quantité d'autres molécules au format PDB (visualisable avec RASMOL) en cherchant sur Internet ou sur une banque de donnée PDB (Protein Data Bank) ou simplement à partir de Wikipedia